Hautveränderungen bei Kleinsäugern können eine Vielzahl an Ursachen haben, die sowohl primär die Haut betreffen können als auch sekundär zu anderen Erkrankungen auftreten. Daher sind auch bei Hautveränderungen eine gründliche Untersuchung und Diagnostik wichtig und sinnvoll.
Je nach Kleinsäugerspezies kommen andere Erkrankungen häufiger vor. So entwickeln weibliche Meerschweinchen häufig Ovarialzysten, welche zu Alopezie führen können. Auch neigen Meerschweinchen zu Schilddrüsenerkrankungen, welche ebenfalls zu Alopezie führen können. Bei Frettchen ist im Gegensatz dazu eine Alopezie eher ein Symptom einer Nebennierenerkrankung. Ektoparasiten und Hautpilze kommen bei allen Kleinsäugern regelmäßig vor.
Hautveränderungen im Maulbereich können durch vermehrten Speichelfluss aufgrund einer Zahnerkrankung entstehen. Beim Kaninchen aber auch ein Symptom einer Kaninchensyphilis sein. Während es sich bei Meerschweinchen um Lippengrind handeln kann.